Postdoktor i klinisk medicin

Lunds universitet grundades 1666 och har under flera år rankats omkring de 100 bästa universiteten i världen. Här finns 42 000 studenter och drygt 7 500 medarbetare i Lund, Helsingborg och Malmö. Vi förenas i vår strävan att förstå, förklara och förbättra vår värld och människors villkor.

Medicinska fakulteten är ett verksamhetsområde inom Lunds universitet, med ansvar för utbildning och forskning inom medicin, vård och hälsa. Utbildningen sker i nära samverkan med sjukvården och är väl förankrad i fakultetens starka forskningstradition. Fakultetens forskning spänner över ett brett fält inom experimentell grundforskning, hälsovård och patientnära forskning. Medicinska fakulteten, med drygt 1800 anställda och 2700 studenter i Lund och Malmö, är en kunskapsintensiv mötesplats för studenter, lärare och forskare från hela världen.



Arbetsuppgifter:

Vi söker en högst motiverad postdoktoral forskare för att ingå i ett samarbetsprojekt mellan två forskargrupper som leds av Emma Niméus och Johan Malmström.

Forskningssamarbetet involverar forskare från Kirurgi-sektionen, Region Skåne vid Skånes universitetssjukhus med Avdelning för Onkologi och Patologi och ”center of excellence” inom biologisk och medicinsk mass spektrometri (CEBMMS) vid Lunds universitet med målsättning att finna sk ”driver” mutationer som kan ge upphov till bröstcancer med hjälp av en proteogenomisk forskningsstrategi. Bröstcancer är den vanligast förekommande cancerformen bland kvinnor i västvärlden och drabbar ungefär var tionde kvinna. Ett lokalrecidiv är ett återfall av bröstcancern i samma bröst som primärtumören och innebär en ökad risk för både fjärrmetastaser och ökad mortalitet. Detektion av lokalrecidiv innebär en terapeutisk möjlighet som kan utnyttjas genom behandling för att förhindra utvecklandet av fjärrmetastaser som idag anses vara icke behandlingsbar sjukdom.

I denna utlysning ämnar vi att använda genomisk sekvensering från individuella tumörer i kombination med mass spektrometri-baserad protein expressions analys för att kunna detektera ”driver” mutationer som kan ge upphov till lokalrecidiv och kunna särskilja ”sanna” lokalrecidiv från nya primär tumörer, som kan vara det första steget i en systemisk spridning. Jämförande analys kommer att genomföras parvis för över 90 insamlade tumörer där primärtumören kan användas som intern kontroll. Full klinisk uppföljning har genomförts för alla patienterna och individuella CRFer (Clinical research form) har skapats.

Arbetsuppgifterna inkluderar preparerande av bröstcancer prover för mass spektrometri analys. De preparerade proverna ska sen analyseras med en eller flera typer av mass spektrometri tekniker så som shotgun MS och målinriktad MS som selected reaction monitoring (SRM) och data-independent analysis (SWATH-MS). Sökande ska därefter kunna integrera proteomik datan med kodande genomdata och genomföra data analys.

Kvalifikationer:

- Doktorsexamen i biologi, computer science eller likvärdigt ämne är ett krav.
- Gedigen tidigare erfarenhet av mass spektrometri är ett krav.
- Tidigare erfarenhet av shotgun och DDA analys är ett krav.
- SRM och DIA är meriterande.
- Bioinformatisk kompetens med tidigare erfarenhet av hantering av stora data mängder och analys av komplex data är meriterande.
- Tidigare erfarenhet av sekvensering är meriterande.
- God kommunikations färdighet och ska kunna behärska skriven och talad engelska väl.

Anställningen är tidsbegränsad till 2 år i enlighet med 4 kap 5 § - 10 § högskoleförordningen (http://www.notisum.se/rnp/sls/lag/19930100.HTM).

Ansökan ska innehålla ett personligt brev, meritförteckning, publikationslista samt kontaktuppgifter till tre referenser.

Lunds universitet välkomnar sökande med olika bakgrund och erfarenheter. Vi ser jämställdhet och mångfald som en styrka och tillgång.
Välkommen med din ansökan!